O julgamento
A partir de 13 de Janeiro de 1431, as declarações feitas na Lorena e noutros locais foram lidas perante o bispo e os seus assessores; deveriam fornecer o quadro para o interrogatório de Joana. Convocada para comparecer perante os seus juízes a 21 de Fevereiro, Joan pediu autorização para assistir à missa com antecedência, mas esta foi recusada devido à gravidade dos crimes de que foi acusada, incluindo tentativa de suicídio por ter saltado para o fosso. Foi-lhe ordenado que jurasse dizer a verdade e fê-lo, mas recusou-se sempre a revelar as coisas que tinha dito a Carlos. Cauchon proibiu-a de sair da sua prisão, mas Joan insistiu que ela estava moralmente livre para tentar escapar. Os guardas foram então designados para permanecer sempre dentro da cela com ela, e ela foi acorrentada a um bloco de madeira e por vezes colocada em ferros. Entre 21 de Fevereiro e 24 de Março, ela foi interrogada quase uma dúzia de vezes. Em todas as ocasiões, era obrigada a jurar de novo dizer a verdade, mas sempre deixou claro que não divulgaria necessariamente tudo aos seus juízes, uma vez que, embora quase todos fossem franceses, eram inimigos do Rei Carlos. O relatório deste interrogatório preliminar foi-lhe lido a 24 de Março, e à parte dois pontos ela admitiu a sua exactidão.
Quando o julgamento propriamente dito começou um dia mais ou menos tarde, Joan levou dois dias para responder às 70 acusações que tinham sido formuladas contra ela. Estas baseavam-se principalmente na alegação de que o seu comportamento demonstrava uma presunção blasfema: em particular, que ela afirmava para as suas declarações a autoridade da revelação divina; profetizava o futuro; endossava as suas cartas com os nomes de Jesus e Maria, identificando-se assim com o romance e o culto suspeito do Nome de Jesus; confessava estar segura da salvação; e usava roupa de homem. Talvez a acusação mais grave tenha sido a de preferir o que ela acreditava serem os mandamentos directos de Deus aos da igreja.
A 31 de Março ela foi novamente interrogada sobre vários pontos sobre os quais tinha sido evasiva, nomeadamente sobre a questão da sua submissão à igreja. Na sua posição, a obediência ao tribunal que a estava a julgar foi inevitavelmente feita um teste a tal submissão. Ela fez o seu melhor para evitar esta armadilha, dizendo que sabia bem que a militante da igreja não podia errar, mas era a Deus e aos seus santos que ela se considerava responsável pelas suas palavras e acções. O julgamento continuou, e as 70 acusações foram reduzidas para 12, que foram enviadas para consideração a muitos teólogos eminentes tanto em Rouen como em Paris.
Mean entretanto, Joan adoeceu na prisão e foi atendida por dois médicos. Recebeu uma visita a 18 de Abril de Cauchon e dos seus assistentes, que a exortaram a submeter-se à igreja. Joan, que estava gravemente doente e pensava que estava a morrer, implorou que lhe fosse permitido ir confessar e receber a Sagrada Comunhão e ser enterrada em solo consagrado. Continuaram a maltratá-la, recebendo apenas a sua constante resposta: “Confio no nosso Senhor, mantenho o que já disse”. Tornaram-se mais insistentes a 9 de Maio, ameaçando-a com tortura se ela não esclarecesse certos pontos. Ela respondeu que mesmo que a torturassem até à morte, ela não responderia de forma diferente, acrescentando que, em qualquer caso, ela sustentaria posteriormente que qualquer declaração que pudesse fazer lhe teria sido extorquida pela força. À luz desta fortaleza de senso comum, os seus interrogadores, por uma maioria de 10 a três, decidiram que a tortura seria inútil. Joan foi informada a 23 de Maio da decisão da Universidade de Paris de que se persistisse nos seus erros seria entregue às autoridades seculares; só elas, e não a igreja, poderiam executar a sentença de morte de um herege condenado.