No enfarte do miocárdio, a isquemia do miocárdio pode estender-se ao endocárdio, perturbando o revestimento interno do coração (enfarte “transmural”). Os enfartes menos extensos são frequentemente “subendocárdicos” e não afectam o epicárdio. No cenário agudo, os enfartes subendocárdicos são mais perigosos do que os enfartes transmurais porque criam uma área de tecido morto rodeada por uma região limite de miócitos danificados. Esta região danificada conduzirá os impulsos mais lentamente, resultando em ritmos irregulares. A região danificada pode alargar-se ou estender-se e tornar-se mais ameaçadora para a vida. No cenário crónico, os enfartes transmurais são mais perigosos devido à maior quantidade de dano muscular e ao desenvolvimento de tecido cicatrizado, levando a uma contratilidade sistólica reduzida, a um relaxamento diastólico prejudicado, e a um maior risco de ruptura e formação de trombos.
Durante a despolarização o impulso é transportado do endocárdio para o epicárdio, e durante a repolarização o impulso passa do epicárdio para o endocárdio.Em endocardite infecciosa, o endocárdio (especialmente o endocárdio que reveste as válvulas cardíacas) é afectado por bactérias.