ABOVE: © SCIENCESOURCE, S. ENTRESSANGLE e E. DAYNES
Após a publicação em 2010 do projecto de sequência do genoma de Neanderthal, o biólogo evolucionário Joshua Akey, depois na Universidade de Washington em Seattle, e o seu estudante graduado Benjamin Vernot começaram a investigar a sua implicação mais provocadora: que os antigos hominídeos tinham criado com os antepassados dos humanos modernos. Os neandertais tinham vivido na Eurásia durante mais de 300 milénios quando alguns antepassados humanos deixaram a África há cerca de 60.000-70.000 anos, e de acordo com a publicação de 2010, na qual os investigadores compararam o genoma do projecto Neandertal com sequências humanas modernas, cerca de 2% do ADN nos genomas dos povos modernos com ascendência eurasiática é de origem neandertal.1
Para investigar a ascendência arcaica da população humana viva, Akey e Vernot puseram-se a trabalhar na procura do ADN Neandertal nos genomas modernos. Desenvolveram uma abordagem estatística para identificar assinaturas genéticas sugestivas da ascendência Neandertal nos genomas de 379 indivíduos europeus e 286 do leste asiático. O esforço foi ainda impulsionado pela primeira sequência de genoma Neandertal de alta qualidade, o que deu à dupla confiança de que as sequências que tinham identificado eram de facto de origem arcaica. Ainda assim, no fundo da mente de Akey, ele tinha dúvidas sobre a investigação. “Lembro-me de dizer ao Ben que estávamos a trabalhar nisto, ‘acordo todos os dias com suor frio que tudo isto é apenas uma classificação incompleta da linhagem'” – um artefacto metodológico que iria minar as suas conclusões sobre a ancestralidade do Neandertal, significando que as sequências eram o resultado da ancestralidade comum que os dois grupos partilhavam.
Então, enquanto Vernot e Akey se preparavam para submeter o seu trabalho para publicação, o seu departamento recebeu a visita de Svante Pääbo, geneticista do Instituto Max Planck de Antropologia Evolutiva, que tinha sido pioneiro em técnicas de extracção e análise de ADN de espécimes antigos e tinha liderado os primeiros esforços do genoma Neandertal. Falaram com ele sobre o seu projecto em curso, e Pääbo notou que o seu colaborador, David Reich da Harvard Medical School, estava a seguir uma linha de investigação muito semelhante. Assim, Akey telefonou a Reich.
“O resultado final foi que concordámos em coordenar a publicação”, recorda Akey. “Também concordámos em não olhar sequer para os trabalhos um do outro porque não queríamos influenciar de forma alguma os resultados”.
Veja “Lançamento Simultâneo”
Foi apenas esta curiosa característica da história humana que não teve impacto, ou alterou a trajectória da evolução humana?
-Joshua Akey, Princeton University
Vernot e Akey submetidos à Ciência;2 Reich e os seus colegas submeteram à Natureza.3 As duas revistas sincronizaram a publicação dos artigos no final de Janeiro de 2014. No dia em que foram ao ar, Akey começou ansiosamente a ler o artigo do grupo do Reich. “Lembro-me de me sentar no meu gabinete, lendo-o, e de passar realmente apenas pela lista de verificação” dos principais resultados, diz ele. Rapidamente, o alívio instalou-se. “Dissemos essencialmente a mesma coisa”, recorda Akey. “Normalmente, quando se publica algo, são anos antes de se ver a validação. . . . Isto foi uma espécie de gratificação instantânea”.
Os dois grupos tinham utilizado abordagens estatísticas diferentes para identificar o ADN Neandertal nos genomas humanos modernos, pondo em causa qualquer cepticismo sobre a história da reprodução cruzada de grupos de hominídeos. ” o prego final no caixão que não podia ser outra coisa”, diz Janet Kelso, bióloga computacional do Instituto Max Planck de Antropologia Evolutiva e colaboradora na publicação do Reich.
Com a edição de Neanderthal/moderno acasalamento humano estabelecido, os cientistas poderiam concentrar-se num novo objectivo, diz Akey, agora na Universidade de Princeton. Nomeadamente, qual foi a consequência desta reprodução cruzada? “Foi apenas esta curiosa característica da história humana que não teve impacto, ou alterou a trajectória da evolução humana?”
Nos últimos cinco anos, uma onda de investigação procurou responder a essa pergunta. As análises genómicas têm associado variantes do Neanderthal com diferenças nos níveis de expressão de diversos genes e de fenótipos que vão desde a cor da pele e do cabelo à função imunitária e à doença neuropsiquiátrica. Mas os investigadores ainda não podem dizer como estas sequências arcaicas afectam actualmente as pessoas, muito menos os humanos que as adquiriram há cerca de 50.000-55.000 anos atrás.
“Até agora não vi nenhum estudo funcional convincente em que se tome a variante do Neandertal e a variante humana e se façam experiências controladas” para identificar a consequência fisiológica, diz Grayson Camp, um genomicista do Instituto de Oftalmologia Molecular e Clínica de Basileia (IOB) na Suíça. “Ninguém demonstrou ainda na cultura que um alelo humano e Neandertal tem uma função fisiológica diferente. Isso será emocionante quando alguém o fizer”
br>h2>Uma História Mista
Alguns 350.000 ou mais anos atrás, o grupo de hominins que evoluiria para se tornar Neandertais e Denisovanos deixou a África para a Eurásia.
A poucas centenas de milénios mais tarde, há cerca de 60.000 a 70.000 anos, os antepassados dos modernos não-africanos seguiram um caminho semelhante para fora de África e começaram a cruzar-se com estes outros grupos de hominídeos. Os investigadores estimam que grande parte do ADN Neandertal nos genomas humanos modernos veio de eventos de reprodução cruzada que tiveram lugar há cerca de 50.000 a 55.000 anos atrás no Médio Oriente. Milhares de anos mais tarde, os seres humanos que se deslocaram para o Leste da Ásia entrecruzaram-se com Denisovans.
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h2>Neanderthal na nossa pele
As variantes da maioria Neandertal só existem em cerca de 2% das pessoas modernas de ascendência eurasiática. Mas algum ADN arcaico é muito mais comum, uma indicação de que era benéfico para os humanos antigos ao mudarem-se de África para a Eurásia, que os Neandertais tinham chamado de lar há mais de 300.000 anos. No seu estudo de 2014, Vernot e Akey encontraram várias sequências de origem Neandertal que estavam presentes em mais de metade dos genomas de humanos vivos que estudaram. As regiões que continham altas frequências de sequências do Neandertal incluíam genes que podiam dar pistas sobre o seu efeito funcional. As diferenças de pares de bases entre o Neandertal e as variantes humanas raramente caem nas sequências codificadoras de proteínas, mas sim nas reguladoras, sugerindo que as sequências arcaicas afectam a expressão dos genes. (Ver “Denisovans in the Mix” abaixo.)
Um número de segmentos abrigam genes que se relacionam com a biologia da pele, tais como um factor de transcrição que regula o desenvolvimento de células epidérmicas chamadas queratinócitos. Estas variantes podem estar subjacentes a traços que foram adaptativos nas diferentes condições climáticas e níveis mais baixos de exposição à luz ultravioleta em latitudes mais a norte. O grupo do Reich encontrou igualmente genes envolvidos na biologia da pele enriquecidos na ancestralidade Neandertal – ou seja, mais do que apenas alguns por cento das pessoas transportaram ADN Neandertal nestas partes do genoma.
Ninguém demonstrou ainda em cultura que um alelo humano e Neandertal tem uma função fisiológica diferente. Isso será excitante quando alguém o fizer.
-Grayson Camp,
Instituto de Oftalmologia Molecular e Clínica Basileia
Não ficou claro, contudo, que efeito específico as variantes do Neandertal tinham no fenótipo. Para isso, os investigadores precisavam de dados fenotípicos sobre muitos tipos diferentes de traços, pareados com informação genética, para milhares de pessoas. O geneticista evolucionista da Universidade de Vanderbilt Tony Capra tem acesso a tal recurso: a Rede Electronic Medical Records and Genomics (eMERGE). Na altura em que a comunidade científica estava a começar a mapear o ADN Neanderthal nos genomas das pessoas vivas, os organizadores do eMERGE estavam a compilar registos de saúde electrónicos e dados genéticos associados para dezenas de milhares de pacientes de nove centros de saúde em todos os EUA. “Sentimos que tínhamos a oportunidade de avaliar algumas dessas hipóteses em maior escala numa população humana real onde tínhamos dados fenotípicos ricos”, diz Capra.
Em colaboração com Akey e Vernot, que ajudaram a identificar variantes do Neandertal nos dados genéticos incluídos na base de dados, o grupo de Capra procurou ligações entre o ADN arcaico e mais de 1.000 fenótipos em cerca de 28.000 pessoas de ascendência europeia. Em 2016, relataram que o ADN Neandertal em vários locais do genoma influencia uma série de características imunitárias e auto-imunes, e que havia alguma associação com a obesidade e desnutrição, apontando para potenciais efeitos metabólicos. Os investigadores também viram uma associação entre a ascendência Neandertal e dois tipos de crescimento de pele não carcinogénico associado a biologia de queratinócitos disfuncionais, apoiando a ideia de que o ADN Neandertal foi a certa altura seleccionado pelos seus efeitos na pele.4
“Isto foi uma loucura para mim”, diz Capra. “O que estes outros grupos tinham previsto com base apenas no padrão de ocorrência – a presença e ausência de ascendência Neandertal em torno de certos tipos de genes – estávamos de facto a ver numa população humana real, que ter ascendência Neandertal influenciou traços relacionados com esses tipos de células da pele”. O que não está claro, contudo, é quais eram os benefícios das sequências Neandertais para os primeiros seres humanos.
Ao mesmo tempo, Kelso e o seu pós-doutoramento Michael Dannemann estavam a adoptar uma abordagem semelhante com uma base de dados relativamente nova chamada Biobank UK (UKB), que inclui dados de cerca de meio milhão de voluntários britânicos que preencheram questionários sobre si próprios, se submeteram a exames médicos, e deram amostras de sangue para genotipagem. Formalmente lançado em 2006, o UKB publicou o seu recurso de 500.000 pessoas em 2015, e Kelso e Dannemann decidiram ver que informação podiam extrair. Convenientemente, os dados de genotipagem incluem especificamente SNPs que podem identificar variantes de origem Neandertal, graças ao grupo do Reich, que forneceu aos arquitectos do UKB uma lista de 6.000 variantes de Neandertal.
entre as muitas ligações que Kelso e Dannemann identificaram ao escavarem dados de mais de 112.000 indivíduos no UKB, havia, mais uma vez, uma associação entre certas variantes de Neanderthal e aspectos da biologia da pele.5 Especificamente, as sequências arcaicas abrangendo o género BNC2 – um trecho do genoma que Vernot e Akey tinham identificado como tendo origem Neandertal em cerca de 70 por cento dos não africanos – estavam muito claramente associadas à cor da pele. As pessoas que transportavam ali ADN Neandertal tinham tendência a ter pele pálida que ardia em vez de bronzeada, diz Kelso. E o trecho que incluía BNC2 era apenas um de muitos, acrescenta ela: cerca de 50% das variantes de Neanderthal ligadas ao fenótipo no seu estudo têm algo a ver com a cor da pele ou do cabelo.
O efeito que o ADN Neandertal pode ter na aparência e função da pele é “fascinante”, diz Akey. “Algo em que ainda estamos realmente interessados e em começar a fazer algum trabalho experimental é: Podemos compreender o que estes genes fazem e depois talvez o que foi a pressão selectiva que favoreceu a versão Neandertal?”
Ver “Efeitos do ADN Neandertal no Homem Moderno”
h2>Denisovans na mistura
Neandertais prosperaram na Eurásia como um grupo homin dominante durante centenas de milhares de anos e têm sido durante muito tempo um foco de investigação científica. Mas há menos de uma década, os investigadores descobriram que havia outro grupo de hominins arcaicos que coexistia com os Neandertais e os antepassados dos humanos modernos. O ADN recolhido de um único osso do dedo e dois dentes parecia não ser nem Neanderthal nem humano, e os cientistas deram o nome a um novo grupo, os Denisovanos, depois da caverna siberiana em que os restos mortais foram encontrados em 2008.
Na altura em que os investigadores reconstituíram todo o genoma Denisovano de alta qualidade em 2012 (Science, 338:222-26, 2012), tornou-se claro que, tal como os Neandertais, os Denisovanos tinham sido criados com humanos modernos durante a época em que coabitavam a Eurásia, com análises que sugeriam que o ADN introgressado provinha provavelmente de múltiplas populações Denisovanas nos últimos 50.000 anos, algum tempo após a mistura ter ocorrido entre Neandertais e antepassados humanos (Cell, 173:P53-61.E9, 2018; Célula, 177:P1010-21.E32, 2019). O ADN denisovano constitui 4-6 por cento dos genomas de pessoas nativas das ilhas da Melanésia, uma sub-região da Oceânia, e em menor grau deixaram a sua marca genética noutras populações de ilhas do Pacífico e em alguns asiáticos modernos do Leste, enquanto que está largamente ausente do código genético da maioria das outras pessoas. Tal como com a introgressão de Neandertal, a questão que permanece por responder é: Que efeito tiveram estas variantes na nossa própria linhagem – e ainda estamos a experimentar a influência genética dos Denisovanos?
Como com o ADN Neandertal, os peritos identificaram regiões de genomas humanos modernos que estão significativamente esgotados de ADN Denisovano, e viram que estes “desertos” eram os mesmos que não tinham sequências Neandertal – indicações de selecção contra variantes deletérias (Science, 352:235-39, 2016). “É o mais próximo que se pode chegar de uma espécie de réplica neste tipo de trabalho”, diz o biólogo evolucionário da Universidade de Princeton Joshua Akey. Em termos de pedaços introgressados de ADN Denisovan que poderiam ter sido benéficos para os seres humanos modernos, os investigadores encontraram ligações a receptores de toll-like e outros contribuintes para a função imunológica, semelhantes às ligações encontradas com variantes de Neandertal.
ADN denisovan pode também ter oferecido alguns benefícios únicos aos humanos antigos. Uma equipa científica identificou variantes Denisovan nos genomas dos inuítes da Gronelândia que incluem genes envolvidos no desenvolvimento e distribuição de tecido adiposo, apontando talvez vantagens na tolerância ao frio e no metabolismo (Mol Biol Evol, 34:509-24, 2017). E talvez a sugestão mais forte de introgressão Denisovan benéfica venha de um estudo de 2014 no qual os investigadores ligaram as sequências arcaicas com adaptação a grande altitude entre as populações que vivem nas terras altas do Tibete (Nature, 512:194-97, 2014). A variante particular em que se concentraram foi tão altamente seleccionada, observa Kelso, que “quase todos os que vivem no planalto transportam este pedaço de ADN Denisovan”
br>h2>Imunidade derivada do Neandertal
Outra área da biologia humana fortemente ligada às variantes do Neandertal no genoma é o sistema imunitário. Dado que os antepassados humanos foram expostos a um grupo de diferentes agentes patogénicos – alguns dos quais vieram directamente dos Neandertais – ao migrarem através da Eurásia, as sequências de Neandertal introduzidas no genoma humano podem ter ajudado a defender-se contra estas ameaças, às quais os Neandertais estavam há muito expostos.
“Desafios virais, os desafios bacterianos estão entre as forças selectivas mais fortes por aí”, diz Kelso. Ao contrário das mudanças noutras condições ambientais, tais como padrões de luz do dia e exposição UV, “os agentes patogénicos podem matar-te numa geração”
Indicações do papel do ADN arcaico na função imunológica surgiram já em 2011, assim que o genoma Neandertal ficou disponível para referência cruzada com sequências de humanos modernos. Uma equipa liderada por investigadores da Universidade de Stanford descobriu que certos alelos do antigénio leucocitário humano (HLA), actores-chave no reconhecimento de patogénicos, continham sinais de ascendência arcaica – dos Neandertais, mas também de outro primo hominimigo, os Denisovans.6 “É um papel fixe e que contribuiu para que muitas pessoas pensassem nos efeitos da introgressão”, diz Capra.
Outros estudos desde então reforçaram a ligação entre o ADN arcaico e a função imunológica, ramificando-se do sistema HLA para incluir numerosas outras vias.7 Por exemplo, múltiplos laboratórios ligaram variantes Neandertais a níveis alterados de expressão de genes que codificam receptores de toll-like (TLRs), actores chave em respostas imunitárias inatas. Em 2016, Kelso, Dannemann, e um colega descobriram que a resposta patogénica e a susceptibilidade de desenvolver alergias estavam associadas a sequências Neandertal que afectam a produção de TLR.8
Vírus, em particular, parecem ser potentes motores de adaptação. No ano passado, o geneticista da população da Universidade do Arizona David Enard e colegas descobriram que um terço das variantes de Neandertal sob selecção positiva estavam ligadas a genes que codificam proteínas que interagem com vírus.9
Desafios virais, os desafios bacterianos estão entre as forças selectivas mais fortes por aí. Os agentes patogénicos podem matá-lo numa geração.
-Janet Kelso, Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology
P>Os investigadores também identificaram várias associações fenotípicas menos fáceis de explicar com a introgressão de Neanderthal. Na sua análise de 2017, por exemplo, Kelso e Dannemann descobriram que as variantes de Neanderthal estavam associadas ao cronótipo – quer as pessoas se identificassem como aves precoces ou noctívagos – quer ligações com susceptibilidade a sentimentos de solidão ou isolamento e baixo entusiasmo ou interesse. As associações com fenótipos relacionados com o estado de espírito estão de acordo com o que o grupo de Capra tinha encontrado no ano anterior no seu conjunto de dados de informação médica, que ligava as variantes de Neandertal aos riscos de depressão e dependência. “Estas eram associações bastante fortes”, diz Capra. “E quando olhámos para os genes onde estas regiões de ascendência Neandertal caíram, em muitos casos fizeram sentido, dado o que já sabemos sobre esses genes”.
Porque é que estas associações existem ainda é um mistério. Kelso suspeita que a luz possa ser um factor unificador, com mudanças nos padrões de duração do dia e reduções da exposição aos raios UV à medida que se deslocam para latitudes mais a norte. Mas isso é apenas um palpite, ela enfatiza.
“É divertido especular sobre como poderia ter sido vantajoso, ou como variantes que nos deprimem no ambiente moderno poderiam ter sido benéficas”, diz Capra. “Nem sei realmente o que significava a depressão há 40.000 anos. Isso é tanto o desafio como a parte divertida e provocadora de tudo isto”
Uma questão de funcionalidade
P>Even com associações mais simples, tais como com traços de pele ou respostas imunitárias, as conclusões até agora são retiradas de correlações entre genótipos e fenótipos. Embora tais abordagens genéticas e estatísticas possam ligar conceptualmente a introgressão Neandertal com os fenótipos e sugerir a razão pela qual tais sequências podem ter sido seleccionadas na história inicial dos humanos, os investigadores ainda não publicaram estudos de validação in vitro.
“Estudar o ADN Neandertal mais de perto a um nível molecular no laboratório é bastante complicado”, diz Dannemann. As variantes de Neanderthal tendem a vir em embalagens, e a ligação entre as variantes torna difícil identificar a função de cada uma delas, explica Dannemann.
Esse desafio não impediu os investigadores de tentar. Como pós-doutorado no laboratório de Pääbo na Alemanha, Camp, juntamente com Vernot, Kelso, e Dannemann, estabeleceu um punhado de organóides do cérebro de linhas de células estaminais pluripotentes induzidas de europeus modernos que variam na sua genética derivada do Neandertal, e rastreou transcriptomas de células únicas à medida que as células cultivadas amadureciam. Os primeiros dados sugerem que as variantes do Neandertal afectam a expressão genética da mesma forma que documentado por trabalhos anteriores, validando o modelo.
Ver “Minibrains May Soon Include Neanderthal DNA”
But such research is still in the proof-of-principle stage, says Camp, who is continuing this work in his own lab in Switzerland. “Agora só precisa de aumentar a produção. Precisa de fazer isto para 100 ou 200 indivíduos”. Mesmo assim, acrescenta, as conclusões que os investigadores serão capazes de tirar serão limitadas. “Sou um pouco cauteloso e talvez pessimista, pode realmente identificar … impactos em alguns resultados fisiológicos”
Há outras questões fundamentais que se estão a revelar difíceis de responder sobre a introgressão de Neanderthal, diz Akey, desde o número de eventos de hibridação até à escala de tempo durante a qual esses eventos tiveram lugar, e se houve preconceitos sexuais nos padrões de fluxo genético. “Há todas estas coisas importantes que são realmente difíceis de estimar”, diz ele. “Penso que o campo está um pouco preso neste momento”. Mas ele espera que à medida que mais genomas de vários grupos arcaicos de hominídeos e de seres humanos modernos forem surgindo em linha, o poder dos investigadores para modelar a forma como todos estes grupos se entrecruzaram irá fortalecer. Um segundo genoma Neandertal de alta qualidade foi publicado em 2017 (Science, 358:655-58), e os investigadores têm agora o genoma de um humano de 40.000 anos de idade que teve um antepassado Neandertal há apenas algumas gerações. No ano passado, os investigadores publicaram a sequência de um híbrido de primeira geração de Denisovans e Neandertais.
Veja “Girl Had a Denisovan Dad and Neanderthal Mom”
Que estes dados irão provavelmente trazer algumas surpresas. Capra encontrou provas, por exemplo, de que alguns dos segmentos Neandertais que se correlacionavam com os fenótipos modernos podem não afectar directamente esses tipos de fenótipos. O seu trabalho descobriu casos em que a correlação foi conduzida por sequências suficientemente próximas no genoma de variantes do Neandertal que os dois aparecem sempre juntos. Estas sequências foram levadas pelo ancestral comum dos Neandertais e dos humanos modernos, mas estavam ausentes no grupo de humanos que fundaram a população eurasiática moderna. Estas variantes, que tinham sido retidas pelos Neandertais, foram então reintroduzidas aos antepassados dos modernos não africanos durante períodos de reprodução cruzada.10 “Estas variantes genéticas existiam nos tempos modernos no contexto Neandertal, mas não eram da ascendência Neandertal”, diz Capra.
Akey encontrou outra reviravolta interessante: os africanos têm ascendência Neandertal. Trabalho não publicado do seu grupo aponta para a possibilidade de alguns dos antigos humanos modernos que criaram com os Neandertais terem migrado de volta para África, onde se misturaram com os humanos modernos de lá, partilhando pedaços de ADN Neandertal. Se for verdade, isso significaria que a África não está desprovida da influência genética dos Neandertais, observa Akey. “Existe o Neanderthal basicamente em todo o mundo”.
h2>All About Regulation
Nos seus estudos seminais de 2014, os grupos de David Reich da Harvard Medical School e Joshua Akey, então na Universidade de Washington, observaram que as variantes do Neanderthal que se correlacionavam com os fenótipos humanos não apareciam nas regiões codificadoras. Dois anos mais tarde, uma análise de genoma publicada por investigadores em França descobriu que a ancestralidade do Neandertal foi enriquecida em áreas ligadas à regulação genética (Cell, 167:643-56.e17, 2016). A implicação foi que as sequências originadas em Neandertais tendem a ter “menos impacto através da proteína e mais impacto através da expressão genética”, diz o coautor Maxime Rotival, geneticista do Instituto Pasteur em Paris.
Para fazer esta pergunta mais directamente, a Akey recorreu ao Projecto Genótipo Expressão de Tecido (GTEx), que catalogou dados de expressão genética de cerca de 50 tecidos para cada um de 10.000 indivíduos. “É este registo de expressão genética em escala realmente fina”, diz Akey. O seu então pós-doutor Rajiv McCoy, agora professor assistente na Universidade Johns Hopkins, desenvolveu um método para avaliar os níveis de RNA do mensageiro com base no qual o alelo estava a ser expresso – o do pai ou da mãe de um indivíduo – e os investigadores aplicaram esta abordagem a pessoas na base de dados GTEx que eram heterozigotas para uma variante particular do Neandertal. Comparando os níveis de expressão com base nos quais o alelo estava a ser expresso, os investigadores descobriram que um quarto dos segmentos de ADN do Neandertal em genomas humanos afecta a regulação dos genes nesses segmentos ou perto deles (Cell, 168:P916-27.E12, 2017).
“Há muito tempo que sabemos que a variação da expressão dos genes é uma importante fonte de variação fenotípica dentro das populações e de divergência fenotípica entre espécies”, diz Akey. “Estávamos interessados em perguntar se as sequências de Neanderthal contribuem para a variabilidade da expressão génica”. A resposta foi um retumbante sim.
p>Atéreo este ano, Rotival e dois colegas calcularam rácios de variantes de Neandertal para não Neandertal em todo o genoma e compararam esses rácios para codificação de proteínas
regiões e várias sequências reguladoras, especificamente melhoradores, promotores, e sítios de ligação de microRNA. Consistentes com resultados anteriores, encontraram um forte esgotamento de variantes Neandertais na codificação de porções de genes, e um ligeiro enriquecimento das sequências arcaicas nas regiões reguladoras (Am J Hum Genet, doi:10.1016/j.ajhg.2019.04.016, 2019). “O que vemos é que nas regiões de codificação, a proporção de variantes arcaicas para não arcaicas é muito menor do que a proporção fora das regiões de codificação”, diz Rotival.
“Isto não é de todo uma surpresa”, diz Tony Capra da Universidade de Vanderbilt, cujo laboratório tem gerado descobertas semelhantes em pessoas de ascendência eurasiática, “mas é realmente agradável vê-lo quantificado de forma muito abrangente””
- R.E. Green et al, “A draft sequence of the Neandertal genome”, Science, 328:710-22, 2010.
- B. Vernot, J. Akey, “Ressuscitando linhagens Neandertal sobreviventes de genomas humanos modernos”, Science, 343:1017-21, 2014.
- S. Sankararaman et al., “The genomic landscape of Neandertal ancestry in presentent-day humans”, Nature, 507:354-57, 2014.
- C.N. Simonti et al., “The phenotypic legacy of admixture between modern humans and Neandertals”, Science, 351:737-41, 2016.
- M. Dannemann, J. Kelso, “The contribution of Neanderthals to phenotypic variation in modern humans”, Am J Hum Genet, 101:P578-89, 2017.
- L. Abi-Rached et al., “The shaping of modern human immun systems by multiregional admixture with archaic humans”, Science, 334:89-94, 2011.
- H. Quach et al., “Genetic adaptation and Neandertal admixture shaped the immune system of human populations”, Cell, 167:643-56.e17, 2016.
- M. Dannemann et al., “Introduction of Neandertal- and Denisovan-like haplotypes contributes to adaptive variation in human toll-like receptors”, Am J Hum Genet, 98:P22-33, 2016.
- D. Enard e D.A. Petrov, “Evidence that RNA viruses drive adaptative introgression between Neanderthals and modern humans”, Cell, 175:P360-71.E13, 2018.
- D.C. Rinker et al, “Neanderthal introgression reintroduziu alelos funcionais perdidos no gargalo humano fora de África”, bioRxiv, doi:10.1101/533257, 2019.
Jef Akst é o editor-gerente de The Scientist. Envie-lhe um e-mail para [email protected].
Clarificação (26 de Setembro): Esta história foi actualizada para alterar as menções de descendência ou ascendência “não africana” para “eurasiática” para evitar confusão. Todos os seres humanos modernos têm ascendência em África. O cientista lamenta qualquer confusão.