Nasceu em Londres, onde recebeu a parte inicial da sua educação na Escola Gramatical St Saviour’s Grammar. No final de 1724 foi enviado para St John’s College, Cambridge, onde obteve uma bolsa de estudo, por volta de 1730, tornou-se Mestre em Artes em 1732, e obteve o grau de MD em 1739. Permaneceu em Cambridge quase dez anos mais tempo a praticar medicina, e deu um curso anual de palestras sobre matéria médica. Em 1746 tornou-se membro do Royal College of Physicians em Londres; e dois anos mais tarde instalou-se em Londres, onde foi eleito membro da Royal Society em 1749, e gozou de uma extensa prática médica durante mais de trinta anos.
Com a idade de setenta e dois anos reformou-se parcialmente, passando os verões numa casa que tinha tomado em Windsor, mas continuou a praticar em Londres durante o Inverno por mais alguns anos. Em 1778 foi nomeado membro honorário da Sociedade Real de Medicina de Paris.
Em 1766, recomendou ao Colégio de Médicos o primeiro desenho das Transacções Médicas, no qual se propunha reunir as observações que pudessem ter ocorrido a qualquer um dos seus corpos, e que provavelmente ilustrassem a história ou cura de doenças. O plano foi logo adoptado, e três volumes (foram) colocados sucessivamente perante o público.
Seu túmulo na Igreja Paroquial de Windsor é de John Bacon.