Au début de 2009, les développeurs d’Ubuntu ont noté que la gestion des paquets au sein d’Ubuntu pouvait être améliorée et consolidée. Les versions récentes d’Ubuntu, telles qu’Ubuntu 9.04 (Jaunty Jackalope), comprenaient cinq applications pour la gestion des paquets qui consommaient de l’espace et d’autres ressources, tout en apportant de la confusion aux utilisateurs. Les applications pouvaient être téléchargées à l’aide de la fonction de base Ajouter/Supprimer des applications ou avec le gestionnaire de paquets Synaptic. Le Software Updater assurait la mise à jour des paquets installés et Computer Janitor nettoyait les paquets qui n’étaient plus nécessaires. L’application Software Sources permettait à l’utilisateur de sélectionner l’emplacement de téléchargement des paquets.
Les développeurs d’Ubuntu se sont fixés comme objectif :
« … il devrait y avoir un mécanisme évident pour installer, supprimer et mettre à jour les logiciels dans Ubuntu, avec un nom évident et une interface que tout le monde peut utiliser. Il devrait y avoir un système coordonné pour les développeurs et les passionnés afin d’améliorer l’utilité des descriptions et autres métadonnées des paquets logiciels. L’interface de mise à jour des logiciels devrait être affinée pour maximiser l’installation volontaire des mises à jour sur les millions d’ordinateurs sur lesquels Ubuntu est installé. Et les projets et les fournisseurs dont les logiciels sont packagés pour Ubuntu devraient être encouragés à fournir des liens vers la présence de leurs logiciels dans le Software Store, au lieu d’instructions d’installation en ligne de commande. »
Canonical a introduit le Software Center progressivement, en commençant par Ubuntu 9.10 (Karmic Koala) avec une fonctionnalité complète attendue par Ubuntu 11.10, en octobre 2011. En mai 2011, le plan avait été en grande partie réalisé :
Octobre 2009 – version 1.0.2 livrée avec Ubuntu 9.10 (Karmic Koala) Introduit une nouvelle interface simple pour localiser, installer et supprimer des logiciels, avec une meilleure sécurité basée sur PolicyKit au lieu de gksudo. Avril 2010 – version 2.0.2 livrée avec Ubuntu 10.04 (Lucid Lynx) LTS Le Centre des logiciels a ajouté des listes de paquets non-applicatifs de manière simplifiée et fournit également des sous-catégories pour les applications et les archives de paquets personnels. Octobre 2010 – version 3.0.4 livrée avec Ubuntu 10.10 (Maverick Meerkat) Permet aux utilisateurs d’acheter des logiciels et affiche un historique des installations, suppressions et achats antérieurs, y compris l’annulation de changements spécifiques. Avril 2011 – version 4.0 livrée avec Ubuntu 11.04 (Natty Narwhal) Ajout de l’évaluation et de la critique des logiciels par les utilisateurs, et la possibilité de voir les évaluations et les critiques des autres utilisateurs Ubuntu participants. Octobre 2011 – Ubuntu 11.10 (Oneiric Ocelot) La cinquième version de Software Center a été réécrite en GTK3, améliorant le design (meilleure intégration avec le thème système, ajout d’une bannière de promotion, liste d’applications plus agréable), le temps de démarrage a également été amélioré. Software Center a été partiellement préparé pour le contrôle tactile en incluant des icônes plus grandes. Le Centre de logiciels intègre également Unity Launcher, qui permet de trier les applications en fonction de leur classement et de la configuration requise. Une partie de la technologie GDebi a également été intégrée pour améliorer la vitesse de traitement des fichiers .deb. 19 décembre 2011 Une édition en ligne du Centre logiciel Ubuntu a été publiée, le Répertoire des applications Ubuntu. La boutique en ligne affiche le même contenu que l’application Software Center, avec un bouton de téléchargement qui ouvre l’application si vous utilisez Ubuntu ou un lien pour télécharger le programme d’installation du système d’exploitation Ubuntu si vous utilisez un système d’exploitation différent. Avril 2012 – Ubuntu 12.04 (Precise Pangolin) Le Software Center d’Ubuntu a gagné de nouveaux éléments monochromes. Canonical a créé une plateforme de développeurs basée sur le Web pour aider les programmeurs à créer des applications pour Ubuntu. Le Software Center inclut une nouvelle catégorie : « Livres et magazines », la possibilité de montrer des présentations vidéo d’applications payantes et des captures d’écran multiples pour une même application. Et a également ajouté le support de la barre de progression pour Software Center.
En août 2015, Chris Hoffman de PC World a critiqué l’application, indiquant que Canonical ne la maintenait pas correctement pendant que les travaux sur l’application de remplacement se poursuivaient. En particulier, il a noté que les applications payantes n’étaient pas prises en charge correctement et que Canonical n’en avait pas informé les développeurs. L’application fonctionne toujours pour l’installation et la gestion des applications de logiciels libres.
En novembre 2015, Canonical a annoncé que le développement prendrait fin et que l’application serait remplacée par GNOME Software dans Ubuntu 16.04 LTS.
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