Bei einem Myokardinfarkt kann sich die Ischämie des Myokards bis zum Endokard ausdehnen und die innere Auskleidung des Herzens zerstören („transmuraler“ Infarkt). Weniger ausgedehnte Infarkte sind oft „subendokardial“ und betreffen nicht das Epikard. In der akuten Situation sind subendokardiale Infarkte gefährlicher als transmurale Infarkte, da sie einen Bereich toten Gewebes schaffen, der von einer Grenzregion geschädigter Myozyten umgeben ist. Diese geschädigte Region leitet Impulse langsamer, was zu unregelmäßigen Rhythmen führt. Die geschädigte Region kann sich vergrößern oder ausdehnen und lebensbedrohlich werden. Im chronischen Stadium sind transmurale Infarkte gefährlicher, da die Muskulatur stärker geschädigt ist und sich Narbengewebe bildet, das zu einer beeinträchtigten systolischen Kontraktilität, einer beeinträchtigten diastolischen Relaxation und einem erhöhten Risiko für Rupturen und Thrombenbildung führt.
Bei der Depolarisation wird der Impuls vom Endokard zum Epikard getragen, bei der Repolarisation bewegt sich der Impuls vom Epikard zum Endokard.
Bei der infektiösen Endokarditis wird der Endokard (insbesondere der die Herzklappen auskleidende Endokard) von Bakterien befallen.