インフルエンザワクチンは、ワクチンに似た分子成分を持つウイルスと戦うための抗体の生成を体に促すことで効果を発揮します。 ワクチンの効果は、少なくとも3つの要素に左右されます。 ワクチンの効果は、少なくとも次の3つの要素に左右されます。1）ワクチンの成分が、そのシーズンの流行の原因となったウイルスの成分とどれだけ似ているか、2）どれだけ効果的に体内で抗体を作ることができたか、3）その抗体がどれだけ持続するか、です。 実際に流行を引き起こしたウイルスとワクチンの適合性については、あるシーズンは他のシーズンよりも優れています。 ワクチンの適合性が高ければ高いほど、予防効果も高くなります。 しかし、インフルエンザウイルスは急速に変異するため、マッチングの度合いはシーズンごとに大きく低下します。 また、人によって、ワクチンに対する抗体の産生レベルが異なる傾向があります。 ワクチンに対する反応が大きい人は、防御力が高く、持続することになります。 さらに、抗体レベルが低下すると（最初の6ヶ月間で約50％、その後2、3年である程度のレベルになります）、防御力も低下します。 このような理由から、CDCは毎年のインフルエンザシーズンに十分な予防をするために、毎年のインフルエンザ予防接種を推奨しています。