骨髄生検は、医療機関のオフィスや病院で行われることがあります。 通常、処置に対するインフォームド・コンセントが必要です。 患者は腹ばい（伏臥位）または横向き（側臥位）で寝てもらいます。 皮膚を清潔にし、リドカインやプロカインなどの局所麻酔薬を注射して患部を麻痺させます。
典型的には、まず吸引を行います。
一般的には、まず吸引を行います。吸引針を皮膚から挿入し、手で押しながら骨に当たるまで押します。
一般的には、まず吸引を行います。吸引針を皮膚から手で押しながら骨に当たるまで挿入し、臨床医の手と手首をひねるようにして、骨皮質（骨の硬い外側の層）から骨髄腔へと針を進めます。 針が骨髄腔に入ったら、注射器を取り付けて、液体の骨髄を吸引する（「吸い出す」）。 吸引の際には、一点から大量のサンプルを採取した場合に起こる可能性のある、サンプル中の血液の過剰含有を避けるために、ねじりながら吸引を行う。 続いて、必要に応じて生検を行う。 別の太いトレフィン針を挿入し、骨皮質に固定する。 その後、針をねじりながら前進させ、回転させて骨髄の固い部分を採取する。 この骨髄片を針と一緒に取り除きます。
複数のサンプルを採取する場合は、血液の凝固を避けるため、サンプルの間に針を抜きます。
処置が完了したら、患者は通常、処置部位を圧迫するために5～10分間横になってもらいます。
処置終了後は、処置部位を圧迫するために5～10分間横になってもらいます。その後、出血がなければ、患者さんは起き上がって通常の活動を行うことができます。 痛みを和らげるためにパラセタモール（別名：アセトアミノフェン）やその他の簡単な鎮痛剤を使用することができますが、これは施術後2～3日は一般的です。 痛みの悪化、赤み、発熱、出血、腫れなどがあれば、合併症の可能性があります。 また、施術後少なくとも24時間は、施術部位を洗わないようにしてください
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