危機の段階（1898年12月10日～1899年10月31日）。 1898年12月10日、パリ条約の調印により、アメリカ政府はスペインからフィリピンを正式に取得した。 1898年12月21日、アメリカ政府はフィリピンに軍政を敷くことを宣言した。 1899年1月5日、フィリピンの民族主義者であるエミリオ・アギナルドがフィリピンの独立を宣言した。 1899年1月23日、マロロスに反政府政権を樹立し、エミリオ・アギナルドが反政府政権の大統領に就任した。 1899年2月4日、マニラで米軍とフィリピン人が衝突した。
紛争期（1899年11月1日～1902年4月13日）。 エミリオ・アギナルドは1899年11月1日からフィリピンで米軍政府に対する反乱を起こした。 1899年12月19日、リケリオ・ジェロニモ将軍が率いる約200人のフィリピン人反乱軍が、ヘンリー・ウェア・ロートン将軍が率いる米軍をサンマテオ付近で攻撃し、ロートン将軍と他の13人の米兵が死亡した。 米軍は1900年4月15日から19日にかけてCatubig付近でフィリピンの反乱軍と衝突し、約150人の反乱軍と少なくとも21人の米軍兵士が死亡した。 米軍は1900年6月4日にカガヤン・デ・ミサミスの近くでフィリピンの反乱軍と衝突し、9人の米軍兵士と1人の反乱軍が死亡した。 米軍は1900年9月13日、Marinduque島のPulang Lupa付近でフィリピンの反乱軍と衝突し、4人の米兵が死亡した。 ベンジャミン・F・チータムJr.大佐が指揮する米軍は、1900年9月17日にマビタック島のフアン・カイレス将軍が指揮するフィリピン反乱軍と衝突し、米兵21人と反乱軍11人が死亡した。 エミリオ・アギナルドは1901年3月23日、アメリカ政府に忠誠を誓うフィリピン軍に捕らえられ、ミゲル・マルバー将軍が反乱軍のリーダーに代わった。 エミリオ・アギナルドは1901年4月19日、アメリカ政府に忠誠を誓った。 1901年9月28日、サマール島のバランギガの町でモロ族が米軍を襲撃し、米兵約48人とモロ族28人が死亡した。 米軍は1902年1月から4月にかけて、バタンガス州に約29万8,000人のフィリピン人を収容する強制収容所（レコンストラード）を設置・維持し、約8,350人のフィリピン人が死亡した。 アメリカ軍とフィリピン軍は、1902年4月16日、ミゲル・マルバル将軍の降伏により反乱を鎮圧した。 この紛争では、約20万人のフィリピン人、4,234人の米軍兵士、2万人のフィリピン人兵士が犠牲になった。 1902年5月2日、フランク・ボールドウィン大佐率いる米軍はミンダナオ島のバヤン付近でモロ人と衝突し、約350人のモロ人と11人の米兵が死亡した。 アメリカ議会は1902年7月1日にフィリピン法を承認し、フィリピンに限定的な自治権を与えた。 1902年7月4日、アメリカ政府はフィリピンの軍事政権に代わり、ウィリアム・ハワード・タフトを首班とする文民政権を樹立した。 1902年7月4日、テディ・ルーズベルト米大統領は、フィリピンの反乱軍に対して大赦を宣言した。 1904年2月1日、ルーク・ライト将軍が米国のフィリピン総督に就任した。 1906年3月5日から7日にかけて、J.W.ダンカン大佐が率いる米軍790名がバド・ダジョ付近でモロ族と衝突し、数百名のモロ族の男女や子供が死亡した。 このとき、21名の米兵が犠牲になった。 1906年4月2日にはヘンリー・クレイ・アイデが、9月20日にはジェームズ・スミスがアメリカのフィリピン総督に就任した。 1907年3月12日、国民党（Partido Nacionalista,- PN）が設立された。 1907年7月30日に立法府選挙が行われ、フィリピン議会では80議席中59議席を国民党が獲得した。 進歩党（Partido Progresista – PP）が16議席を獲得したのである。 フィリピン議会は1907年10月16日にマニラで召集された。 1909年11月2日に立法院選挙が行われ、フィリピン議会では国民党（Partido Nacionalista,- PN）が81議席中62議席を獲得しました。 進歩党（Partido Progresista – PP）はフィリピン議会で17議席を獲得した。 1909年11月11日、ジョン・J・パーシング少将がモロ州の知事に就任した。 1911年9月8日、パーシング少将は、モロ州のモロ人を完全に武装解除するための行政命令を出した。 1912年6月4日に立法府選挙が行われ、フィリピン議会では国民党（Partido Nacionalista,-PN）が81議席中62議席を獲得した。 進歩党（Partido Progresista – PP）が16議席を獲得した。 1913年6月15日、アメリカ軍はフィリピン南部で14年間続いたモロ族の反乱を鎮圧した。 この反乱では、少なくとも1万人のモロ族、630人の米兵、116人のフィリピン兵、750人のフィリピン警察が犠牲になった。
危機後の段階（1913年6月16日～1941年12月7日）。 1913年8月21日、フランシス・ハリソンがアメリカのフィリピン総督に就任した。 1916年6月6日に行われた立法府選挙では、下院90議席のうち75議席を国民党が獲得した。 1916年8月29日、米国議会はジョーンズ法を承認し、フィリピンの議会は下院と上院の二院制となった。 1919年6月3日に立法府の選挙が行われ、下院では国民党（Partido Nacionalista、PN）が90議席中75議席を獲得した。 1921年10月5日、レナード・ウッド将軍がアメリカのフィリピン知事に就任した。 1922年6月6日、立法院選挙が行われ、下院では国民党（Partido Nacionalista,PN）の2大派閥が93議席中64議席を獲得した。 1924年11月19日、フィリピン議会は、米国からの「完全かつ完璧な独立」を求める決議を承認した。1925年6月2日に立法院選挙が行われ、国民党（Partido Nacionalista,- PN）が下院で92議席中64議席を獲得した。 1925年12月7日、フィリピン議会は独立を求める請願書を米国議会に提出した。 1926年7月26日、フィリピン議会は独立に関する国民投票を求める決議を承認したが、ウッド知事はこの決議に拒否権を行使した。 ウッド知事は1927年8月7日に死去し、1927年12月13日にヘンリー・スチムソンが米国のフィリピン知事に就任した。 1929年5月17日、ドワイト・デービスがフィリピンの米国知事に就任した。 1928年6月5日、立法院選挙が行われ、下院では国民党（Partido Nacionalista、PN）が94議席中71議席を獲得した。 1931年6月2日に行われた立法府選挙では、下院86議席中66議席を国民党が獲得しました。 1934年3月24日、アメリカ議会は、12年後のフィリピン独立を約束するタイディングス・マクダフィー法を承認した。 1934年6月5日に立法委員会選挙が行われ、下院では独立派の国民党（Partido Nacionalista、PN）が92議席中70議席を獲得した。 国民党の反独立派（Partido Nacionalista – PN）は、下院で19議席を獲得した。 1934年のタイディングス・マクダフィー法に基づき、1934年7月10日に憲法制定会議の代表者選挙が行われた。 ベニグノ・ラモスは、1935年5月1日から2日にかけて、ブラカン州とラグナ州で政府に対する右翼の反乱を起こし、約100人の死者を出しました。 ベニグノ・ラモスは日本に逃亡した。 1935年5月14日に行われた国民投票で、フィリピン連邦を設立する憲法が有権者の96％の賛成で承認された。 1935年9月15日に立法府選挙が行われ、下院では国民党（Partido Nacionalista、PN）のマヌエル・ルイス・ケソン派（独立派）が98議席中64議席を獲得していた。 国民党（Partido Nacionalista – PN）のセルジオ・オスメーニャ（Sergio Osmeña）氏の派閥は、下院で19議席を獲得しました。 1935年9月15日、国民党（Partido Nacionalista,- PN）のマヌエル・ルイス・ケソンが連邦大統領に選出された。 1935年11月15日、フィリピン連邦が正式に設立された。 1938年11月8日に立法府選挙が行われ、国民党（Partido Nacionalista,- PN）が下院の98議席のうち98議席を獲得した。 1940年6月18日に行われた憲法制定のための国民投票では、二院制のフィリピン議会の設立を含むいくつかの憲法改正が承認された。 1941年11月2日に行われた立法府選挙では、国民党（Partido Nacionalista、PN）が下院98議席中95議席を獲得した。
危機の段階（1941年12月8日～1945年10月17日）。 1941年12月8日、日本軍機がフィリピンの米軍クラーク飛行場を攻撃し、米軍関係者80名が死亡した。 1941年12月22日、本間正晴大将率いる日本軍約4万3000人がルソン島、ミンダナオ島、ジョロ島に侵攻。 日本軍がマニラを制圧したのは1942年1月2日である。 在比米軍司令官ダグラス・マッカーサー元帥は、1942年3月11日にバタン半島から退去した。 1942年4月9日、エドワード・キング将軍が指揮する約1万2千人の米軍と5万8千人のフィリピン軍は、ルソン島で日本軍に降伏した。 ジョナサン・ウェインライト少将が指揮するアメリカ政府軍は、1942年5月6日、コレヒドール島で日本軍に降伏した。 マヌエル・ルイス・ケソン大統領はアメリカに亡命し、ワシントンDCに英連邦亡命政府を設立した。 日本の占領下、1943年9月20日にフィリピン第二共和国の国民議会選挙が行われ、ベニグノ・アキノ・Sr.率いるKapisanan sa Paglilingkod sa Bagong Philinas – KALIBAPIが国民議会の108議席中108議席を獲得した。 1943年10月14日、国民議会でホセ・パシアーノ・ラウレルがフィリピン第二共和国の大統領に選出された。 1944年8月1日、マヌエル・ルイス・ケソン大統領がニューヨーク州で死去し、1944年8月1日、セルジオ・オスメーニャ副大統領が英連邦亡命政府の大統領に就任した。 ホセ・パシアノ・ラウレル大統領は1944年9月22日、フィリピンに戒厳令を布告し、9月23日にはアメリカとイギリスに戦争状態を宣言した。 1944年10月20日、マッカーサー元帥率いるアメリカ政府軍がレイテ島に上陸。 1944年10月25日、日本海軍の艦艇がフィリピン地域から撤退し、10月26日、米軍がサモス島に上陸しました。 1944年12月24日、米軍はレイテ島を占領しました。 米政府軍は、1945年1月9日にルソン島の日本軍を攻撃し、8月15日にルソン島を占領しました。 アメリカ政府軍は1945年2月16日から27日にかけて、コレヒドール島を占領しました。 米政府軍は1945年4月17日にミンダナオ島の日本軍を攻撃し、8月15日にミンダナオ島を占領した。 日本に逃亡していたホセ・パシアノ・ラウレルは、1945年8月17日、フィリピン大統領を正式に辞任した。 1945年9月2日、日本はアメリカに正式に降伏した。
危機後の段階（1945年9月3日～1946年7月4日）。 1946年4月23日、国民党自由党のマヌエル・アクーニャ・ロハスが55％の得票率でフィリピン連邦大統領に選出され、4月28日に大統領に就任した。 1946年4月23日に立法府選挙が行われ、下院では国民党の自由主義派（Partido Nacionalista,- PN）が98議席中49議席を獲得した。 下院では国民党（Partido Nacionalista,- PN）が35議席を獲得しました。 フィリピン共和国は、1946年7月4日にアメリカから正式に独立しました。