ゲノム配列の研究は退屈なものです。 それは、研究の数が多すぎるということではなく、新しいことが何もわからないということです。
「子宮筋腫」と「ゲノム」を同じ文章で読むことになるとは思ってもみませんでした。
子宮筋腫のゲノムをシークエンシングする
子宮筋腫は大きな良性の腫瘍で、女性の約4分の3の子宮にブドウのように群生しています。
私は手術台の上で、産科医が私の真ん中から真ん中の娘を引っ張って、スパゲッティ・スカッシュを二等分するような縦の帝王切開をしているときに、個人的にこの腫瘍に遭遇しました。
「大変です！ちょっと手伝ってください」と主治医がトレイを持って待機していた看護師に声をかけました。
「リッキー、ここには子宮筋腫があります。
「リッキー、ここに子宮筋腫があります。 彼女が娘の頭のことを言っていないことを祈りました。
子宮筋腫については、Medscapeの記事を読むまでは考えたこともありませんでした。 ヘルシンキ大学の研究者たちは、あらゆる種類の分析を行いました。 ポイントミューテーションを発見するための全ゲノムシーケンスに加え、シーケンスでは見逃されるタイプのミューテーション、つまりコピー数の変異、インデル（挿入と欠失）、再配列を特定しました。
研究者は30人の女性から38個の子宮筋腫を調べました。 子宮筋腫の細胞には、がん遺伝子とがん抑制遺伝子の2つの突然変異があることがすでに知られていました。 研究者たちは、そのどちらかを持つ腫瘍を選んで精査し、それらを持たない腫瘍と比較しました。
これらの研究の結果、子宮筋腫は、異なる子宮であっても非常によく似ていることがわかりました。 しかし、一人の女性の中で、子宮筋腫はクローン的につながっています。それはまるで、地面の下でつながっている木（ポプラ？ 子宮内の子宮筋腫は、1つのリーダー的な腫瘍に由来する傾向があり、研究者は、異なる子宮筋腫のゲノムを、共通の染色体異常に基づいて整列させることで、その系統を解読します。
しかし、染色体レベルでは話が違います。
かつて私は、「In cancer, the genome is shot to hell」という言葉で『サイエンティスト』誌の記事を始めました。
The Scientist誌の記事の冒頭で、”In cancer is shot to hell “と書いたことがあります。
それは細胞学的なメガオルガズムのようなもので、いくつかの染色体が雷のような一回限りの爆発的な出来事を経験し、粉々に砕け散ります。 その後、DNA修復部隊が登場しますが、彼らは失敗します。 染色体が実際に粉々になってしまった場合、細胞は細胞周期の出口に到達すると、アポトーシス（破滅）へと導かれていきます。 しかし、ほんの数本の染色体が壊れただけなら、DNA修復酵素がそれらをつなぎ合わせようとする。 そして失敗します。 その結果、染色体が混乱し、細胞周期のブレーキが永遠に解除されてしまうのです。
これまで染色体再配列はがん細胞でのみ知られていましたが、良性の子宮筋腫では知られていなかったため、研究者たちは今回発見されたものを「相互に連結した複雑な染色体再配列」、つまり「CCR」と名付けました。これまでは、誰の母親も好きだった60年代のクリーンなバンド、クリーデンス・クリアウォーター・リバイバルを意味していました。 願わくば、この発見が、帝王切開を受ける患者に「野球ボールを産んだ」と産科医が言わなくて済むように、何かできることを示唆してくれればと思います。
TERATOMAS: THE ‘MONSTER’ MASSES
先週の子宮筋腫についての記事で、もっと興味深い良性腫瘍である奇形腫を思い出しました。 ギリシャ語で「怪物の塊」を意味する奇形腫は、人間の正常な胚の部分が露出したもので、胚の3つの層の代表的な部分も含まれます。
奇形腫には、髪の毛、歯、皮膚のほか、たまに腺、指、眼球などが含まれることがあります。
奇形腫には、髪の毛や歯、皮膚、ときには腺や指、眼球などが含まれることがありますが、これは通常、精子や卵子が誤って発生プログラムを起動させたり、初期の胚が自分が全体の一部ではなくなったことに気づかずに体細胞を脱出させたりして発生するものです。
テラトーマが科学史において重要なのは、その研究がヒト胚性幹細胞(hES)の発見につながったからであり、そのことについては数年前に『The Scientist』誌やエッセイ集で紹介しました。
幹細胞の時代は、通常、マウスからES細胞が得られた1981年にさかのぼります。 その論文は4,000件近く引用されています。 しかし、「胚性幹細胞」という言葉が初めて登場するのは、ジャクソン研究所のリロイ・スティーブンスという研究者が1970年に発表した論文（引用回数464回）で、彼は1950年代に奇形腫を持つマウスから細胞を分離し始めていました。
私のエッセイ本は『Discovery: Windows On The Life Sciences』というもので、2000年にBlackwell社から出版されました。 地球上で8人の人が読みましたが、一人のレビューが、アマゾンのランクが示すほどひどいものではないことを示唆しています。 アマゾンはタイトルを間違えたし。 とにかく、「ディスカバリー」には私のお気に入りの記述があります。ワイリーがブラックウェルを食いつぶし、私が自分の作品を引用する許可を誰に求めていいかわからないので、ここに紹介します。 女性の腹部にある800ポンドの塊には、歯や髪の毛、そして様々な種類の組織が混ざっています。
医学文献にも同様に奇妙な報告があります。生まれたばかりの女の子の腰には「未発達の人間の下半身」があり、若い男性の左目の代わりには「緑がかった大きな塊」があり、その中には胎児の軟骨、脂肪、筋肉、腸、脳の断片が含まれています。
別のケースでは、女性の骨盤の中で、顎と思われる部分に完璧な臼歯が埋め込まれているのがX線ではっきりと確認できます。 また、早くに思春期を迎えた若い男性が、脳にある松果体に胚の特徴的な細胞層を成長させたという報告も10件ほどあります。 もっと一般的なのは、胚や胎児ではなく、特殊な組織の無秩序な塊を身ごもった妊婦で、歯や髪の毛を含むこともある不定形の塊を出産することである。
自分の知識をアップデートするために、テラトーマをグーグルで検索してみると、1980年代の論文や本の章、クライアントのhES細胞やiPS細胞をマウスに移植する研究契約ラボなどがたくさん出てきました。 ネズミのお腹にテラトーマが形成されれば、移植された細胞は、胚の3つの組織層（中胚葉を挟む外胚葉と内胚葉）すべてを生み出すため、多能性という定義基準を満たしていることになります。
子宮筋腫とテラトーマは、見た目以外にどのような違いがあるのでしょうか。 子宮筋腫は、身近な遺伝子の変化によって引き起こされるのに対し、奇形腫は遺伝子の発現の変化によって進化するようです。 子宮筋腫の遺伝子は突然変異し、その染色体は粉々になります。
子宮筋腫と奇形腫という2つのタイプの成長は非常に魅力的です。
子宮筋腫と奇形腫、どちらのタイプの成長も非常に魅力的で、受精卵がどのようにして自分のゲノムにアクセスし、その子孫細胞がどのようにして、人体のように驚くほど複雑で美しいものを形成することができるのか、改めて不思議に感じます。