肺胞ガス方程式は、容易に測定可能ないくつかの変数から肺胞酸素量を推定します。 計算を実行して得られたpAO2は、患者に存在するシャントの程度を見分けるために使用することができます。
pAO2 = FiO2 (Patm – pH20) – (paCO2/RER)
一般人の呼吸交換比 (RER) (または呼吸商) は、通常0.8と考えられています。
海面上の気圧は760mmHgで、体温での水の蒸気圧は47mmHgです。
pAO2 = (FiO2 x 713 mmHg) – (paCO2/0.8)
高度が上がると気圧が下がることから、FiO2があればpAO2は低くなり、結果としてpaO2も低くなります。 例えば、海面で100%酸素を吸うと肺胞のpO2が663mmHgになるのに対し、エベレスト山で気圧263mmHgの中で100%酸素を吸うと、pAO2が166mmHgになります（pH2O、paCO2、RERが同じと仮定）。
その結果、低酸素状態となり、呼吸性アルカローシス（急性高山病で見られる）、精神状態の変化、心拍数と心拍出量の増加、全身血管抵抗の減少、肺血管収縮／高血圧（慢性高山病で見られ、肺気腫が発生する可能性がある）、脳浮腫など、あらゆる生理学的変化が引き起こされます。
逆に、気圧を上げると溶存酸素量が増えて大きな効果が得られます。
必ずしも高度に限ったことではありませんが、肺胞ガス方程式は、方程式の他のすべての変数が安定していれば、定義上、低換気（およびPaCO2の増加）は相対的な低酸素血症をもたらすことを示しています。
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