Cummins ISXディーゼルエンジンは、ディーゼル燃料と天然ガスで正常に作動するデュアルフューエル構成で運転することができます。 天然ガスの代替燃料を燃焼させることで、ディーゼルの熱効率を維持することができます。 効率の良いエンジンは、排出ガスの量も少なくなります。 ISXでは、点火の遅れや噴射のタイミングを変えることでこれを実現しています。 エンジンのコンピュータは、燃焼開始時期（SOC）を調べることで、点火遅延の予測相関を採用しています。 予測されたエンジンの特性は、与えられた燃料源に対して効率と有用なパワーの両方を最大化します。 天然ガスに対しては、パワーバンドと動作範囲が顧客にとって機能するように補正され、同時に排出ガスも削減されます。 EPA（米国環境保護庁）が実施したCummins ISXの天然ガス使用テストでは、NOx排出量を大幅に削減する結果が得られています。 その結果、NOxの排出量を大幅に削減することに成功しました。現在のEPA基準よりも90％も低いNOx排出量を誇ります。 これにより、天然ガスを使用するCummins ISXは、世界で最もクリーンなディーゼルエンジンの一つとなりました。 また、ISXには、EPAが要求するDPF（ディーゼル・パティキュレート・フィルター）が採用されています。 このDPFは、エンジンの排気に含まれる固体粒子をろ過し、テールパイプの排出量を削減します。 しかし、DPFは複雑な構造をしているため、定期的にメンテナンスを行う必要があります。 DPFのメンテナンスは、排出ガス制御システムがフィルターの再生を行い、微粒子を燃やします。 潤滑油の添加剤に含まれる不燃物はDPF内に残り、背圧や効率の問題を引き起こす可能性があります。 このため、Cummins ISXではDPFを定期的に取り外して清掃する必要がある。 灰分を含まないオイルは、洗浄が不要になる可能性がありますが、潤滑特性を阻害する可能性があります。 リンを含まないオイルが研究され、DPFシステムと潤滑に最適であることがわかりました。 このオイルは、ピストン堆積物とオイル消費量の両方で合格点を得ており、リンゼロの超低硫黄オイルを使用することでDPFシステムが最適化されることになります。 また、Cummins ISXは、EPA（米国環境保護庁）の要件が変更された後のモデルでは、DEF（ディーゼル排気液）を使用しています。 DEFとは、ディーゼルエンジンの排出ガスを削減するために尿素を注入するシステムです。 Cummins ISXでは、DEFシステムの特定の故障に備えて、抑制剤の設置が義務付けられています。 DEFタンクの残量が少なくなったり、空になったりすると、ISXはパワーを25％カットします。 また、DEFシステムが不正に操作されたり、正常に機能していない場合には、電源の切断やドライバーへの警告が行われます。 カミンズ社は、DEFシステムを可能な限り機能させるために、いくつかの不具合を修正し、数百万マイルに及ぶCummins ISXのオンロード使用の顧客ベースの調査を行いました。
また、このシステムは、排出ガスを最小限に抑えるために、いかなる問題があっても出力を低下させることが要求されています。