O uso de cirurgia para tratar uma fractura de Jefferson é algo controverso. O tratamento não cirúrgico varia dependendo se a fractura é estável ou instável, definida por um ligamento transverso intacto ou quebrado e grau de fractura do arco anterior. Um ligamento intacto requer a utilização de um colar macio ou duro, enquanto que um ligamento rompido pode requerer tracção, uma auréola ou cirurgia. A utilização de halos rígidos pode levar a infecções intracranianas e são frequentemente desconfortáveis para os indivíduos que os usam, podendo ser substituídos por uma alternativa mais flexível dependendo da estabilidade dos ossos lesionados, mas o tratamento de uma lesão estável com um colar de auréola pode resultar numa recuperação total. O tratamento cirúrgico de uma fractura de Jefferson envolve a fusão ou fixação das três primeiras vértebras cervicais; a fusão pode ocorrer imediatamente, ou mais tarde durante o tratamento nos casos em que as intervenções não cirúrgicas não sejam bem sucedidas. Um factor primário na decisão entre intervenção cirúrgica e não cirúrgica é o grau de estabilidade, bem como a presença de danos noutras vértebras cervicais.
Embora uma lesão grave, as consequências a longo prazo de uma fractura de Jefferson são incertas e podem não afectar a longevidade ou as capacidades, mesmo que não sejam tratadas. O tratamento conservador com um dispositivo de imobilização pode produzir uma excelente recuperação a longo prazo.