Regular articleHepatitis C Virus RNA Real-Time Quantitative RT-PCR Method Based on a New Primer Design Strategy (日本語)

ウイルスの核酸は、採取や取り扱い、保存が不適切だと不安定になるため、現在市販されている定量的な核酸検査キットの感度が低下します。 我々は、既知の不安定なC型肝炎ウイルスRNAを用いて、核酸の不安定性が核酸検査に与える影響を軽減するために、新しいプライマー設計戦略に基づく定量的RT-PCR法を開発した。 本法の性能は,直線性,検出限界,精度,特異性,および市販のC型肝炎ウイルス測定法との一致について評価した. また,本法の臨床応用について,2つの市販キット(CAP/CTM(Cobas AmpliPrep/Cobas TaqMan)およびKehua)と比較した. その結果、定量的RT-PCR法は、直線性R2 = 0.99、総検出限界(ジェノタイプ1~6)42.6 IU/mL(95% CI, 32.84 to 67.76 IU/mL)、CV 1.0.06±1.96 log IU/mL(範囲:-0.38~0.25 log IU/mL)で、CAP/CTM法との高い一致率(R2 = 0.97)を示しました。 本法は、不安定なC型肝炎ウイルスRNAを検出する上で、市販のアッセイよりも優れていました(P 0.05)。 この定量的RT-PCR法は、核酸検査におけるRNAの不安定性の影響を効果的に排除できる。 また、プライマーデザイン戦略の原理は、他のRNAやDNAウイルスの検出にも応用できると考えられます。

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