Detección de un evento de cuello de botella genético reciente en la raza de ganado de montaña india Bargur utilizando marcadores de microsatélite

El número efectivo de individuos criables es un determinante crucial para mantener la variabilidad genética dentro de una población. La población de Bargur, el ganado de montaña del sur de la India, se ha reducido drásticamente en más del 93% en las últimas tres décadas, y en la actualidad sólo se dispone de unos pocos miles de animales. El presente estudio se llevó a cabo para evaluar el equilibrio de la deriva de las mutaciones en el ganado de Bargur y para detectar la aparición de un cuello de botella genético reciente, si es que lo hay, en esta población. Se tomaron muestras de unos 50 animales no emparentados, fieles al tipo, y se les asignó el genotipo de 25 loci microsatélites. La heterocigosidad media observada (0,808 ± 0,023) fue superior a la heterocigosidad media esperada (0,762 ± 0,008), y 15 de los 25 loci de microsatélites mostraron un exceso de heterocigosidad cuando se supuso que estaban en equilibrio de Hardy-Weinberg. Para evaluar el equilibrio de deriva de mutaciones en el ganado de Bargur, se realizaron tres pruebas bajo tres modelos de mutación diferentes, a saber, el modelo de alelos infinitos (IAM), el modelo de mutación por pasos (SMM) y el modelo de dos fases (TPM). La diversidad génica observada (H (e)) y la diversidad génica de equilibrio esperada (H(eq)) se estimaron bajo diferentes modelos de evolución de los microsatélites. Se comprobó que los 25 loci presentaban un exceso de diversidad génica según el IAM y el TPM, mientras que 22 loci presentaban un exceso de diversidad génica según el SMM. Las tres pruebas estadísticas, a saber, la prueba de signos, la prueba de diferencias estandarizadas y la prueba de rango de signos de Wilcoxon, revelaron una desviación significativa (P < 0,01) de la población bovina de Bargur respecto al equilibrio de mutación-deriva bajo los tres modelos de mutación. Además, la prueba cualitativa de la distribución de las frecuencias alélicas en la población bovina de Bargur reveló un fuerte cambio de modo respecto a la forma normal en L, lo que sugiere que la población había experimentado un cuello de botella genético en el pasado reciente. La aparición del cuello de botella genético podría haber provocado la pérdida de varios alelos raros en la población, lo que apunta a la necesidad de realizar esfuerzos para conservar este importante germoplasma bovino. El presente estudio es el primer informe que demuestra la base genética del cuello de botella demográfico en una población bovina india.

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