Rilevamento del verificarsi di un recente evento di collo di bottiglia genetico nella razza di bestiame delle colline indiane Bargur utilizzando marcatori microsatelliti

Il numero effettivo di individui riproducibili è un fattore cruciale per mantenere la variabilità genetica all’interno di una popolazione. La popolazione di Bargur, il bestiame di collina dell’India meridionale, è diminuita drasticamente di oltre il 93% negli ultimi tre decenni, e solo poche migliaia di animali sono attualmente disponibili. Il presente studio è stato intrapreso per valutare il bestiame di Bargur per l’equilibrio della deriva delle mutazioni e per rilevare il verificarsi di un recente evento di collo di bottiglia genetico, se presente, in questa popolazione. Circa 50 animali non imparentati, fedeli al tipo, sono stati campionati e genotipizzati in 25 loci microsatellitari. L’eterozigosi media osservata (0,808 ± 0,023) era superiore all’eterozigosi media attesa (0,762 ± 0,008) con 15 dei 25 loci microsatellitari che mostravano un eccesso di eterozigosi quando si assumeva l’equilibrio di Hardy-Weinberg. Per valutare il bestiame di Bargur per l’equilibrio della deriva delle mutazioni, sono stati eseguiti tre test sotto tre diversi modelli di mutazione, vale a dire, modello di allele infinito (IAM), modello di mutazione graduale (SMM) e modello a due fasi (TPM). La diversità genica osservata (H (e)) e la diversità genica di equilibrio prevista (H(eq)) sono state stimate sotto diversi modelli di evoluzione dei microsatelliti. Tutti i 25 loci sono risultati presentare un eccesso di diversità genica sotto IAM e TPM, mentre 22 loci avevano un eccesso di diversità genica sotto SMM. Tutti e tre i test statistici, cioè il test dei segni, il test delle differenze standardizzate e il test di Wilcoxon, hanno rivelato una deviazione significativa (P < 0.01) della popolazione bovina di Bargur dall’equilibrio di mutazione-deriva sotto tutti e tre i modelli di mutazione. Inoltre, il test qualitativo della distribuzione delle frequenze alleliche nella popolazione di bovini di Bargur ha rivelato un forte spostamento di modalità dalla normale forma a L, suggerendo che la popolazione ha subito un collo di bottiglia genetico nel recente passato. Il verificarsi del collo di bottiglia genetico potrebbe aver portato alla perdita di diversi alleli rari nella popolazione, che indicano la necessità di sforzi per conservare questo importante germoplasma bovino. Il presente studio è il primo rapporto che dimostra la base genetica del collo di bottiglia demografico in una popolazione di bovini indiani.

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