Centrum Muzeum mafii stanowi sala sądowa na drugim piętrze, która była miejscem jednego z czternastu krajowych przesłuchań Komisji Kefauvera, mających na celu zdemaskowanie zorganizowanej przestępczości, które odbyły się w 1950 i 1951 roku. Muzeum nabyło również ceglany mur, na którym miała miejsce masakra w Dzień Świętego Walentego. Inne eksponaty koncentrują się na przemocy mafijnej, operacjach wyłudzania pieniędzy z kasyn i podsłuchach prowadzonych przez organy ścigania. W 2018 roku, po gruntownej renowacji, na pierwszym piętrze dodano nowy eksponat o nazwie Organized Crime Today.
Zwiedzanie z przewodnikiem rozpoczyna się na trzecim piętrze, gdzie wyświetlana jest rzeczywista ściana masakry w dniu Świętego Walentego, dostępna za pomocą windy lub schodów, i wije się w dół do drugiego i pierwszego piętra. Zwiedzający mogą obejrzeć film o historii przestępczości zorganizowanej (począwszy od czasów prohibicji). Główną część wystawy stanowią zdjęcia związane z mafią z podpisami wyjaśniającymi znaczenie poszczególnych obrazów, ale także z jakimi osobami/wydarzeniami były one związane.
Muzeum oferuje szeroki wachlarz tematycznie zorientowanych działów poruszających kwestię zaangażowania mafii w nielegalne działania, takie jak hazard, narkotyki, prostytucja i przemyt oraz wysiłki organów ścigania mające na celu przeciwdziałanie i eliminację tych przestępczych operacji. Dodatkowo zwiedzający ma możliwość obejrzenia wyjątkowo niepokojących, rzadko dostępnych materiałów, np. zdjęć ofiar najsłynniejszych morderstw przypisywanych mafii (odpowiednio nazwanych „Mob’s Greatest Hits”; mają one dość graficzny charakter, ponieważ pokazują prawdziwe zwłoki zmarłych), a także zdjęć i krótkich biografii najpopularniejszych i najbardziej znanych postaci gangsterskich. Specjalna ściana przy wyjściu przedstawia wizerunki wszystkich aktorów, którzy wcielili się w znanych gangsterów w filmach lub serialach. Znaczna część eksponatów jest interaktywna; w całym muzeum znajduje się również kilka stacji, na których odtwarzane są w pętli odpowiednie materiały filmowe.
Na pierwszym piętrze znajduje się sklep z pamiątkami. Dzięki zdjęciom, tekstom, wyświetlaczom, technikom interaktywnym, eksponatom praktycznym i innym pierwszorzędnym metodom muzealnym, zwiedzający poznaje historię przestępczości zorganizowanej, prohibicji i możliwości biznesowych, jakie ona stwarzała. Zwiedzający dowiadują się o pierwszych kasynach w Las Vegas, Howardzie Hughesie, J. Edgarze Hooverze, początkach FBI, Alu Capone, Eliocie Nessie i wielu innych. Zwiedzający może usiąść na replice krzesła elektrycznego, słuchać rzeczywistych podsłuchów, trenować w symulatorze szkoleniowym użycia siły i zbadać interaktywny eksponat laboratorium kryminalistycznego związany z naukami sądowymi.
W kwietniu 2018 roku muzeum otworzyło w pełni działający speakeasy i destylarnię w ich eksponacie w piwnicy, The Underground. W przestrzeni znajdują się eksponaty związane z historią kultury ery prohibicji, a także bootleggers, rumrunners i moonshiners, którzy zapewnili Amerykanom nadal dostęp do trunków podczas 13 lat federalnej prohibicji. Muzeum destyluje swój własny 100 proof, 100% kukurydziany bimber w zbudowanym na zamówienie pot still znajdującym się w Underground. W 2019 roku Mob Museum zaczęło sprzedawać swój bimber za pośrednictwem sklepów Lee’s Discount Liquor w Las Vegas Valley. Bimber z muzeum był wcześniej dostępny tylko w The Underground.