O número efectivo de indivíduos reprodutíveis é um determinante crucial para manter a variabilidade genética dentro de uma população. A população de Bargur, o gado de montanha do Sul da Índia, diminuiu drasticamente em mais de 93 % nas últimas três décadas, e apenas alguns milhares de animais estão actualmente disponíveis. O presente estudo foi realizado para avaliar o gado de Bargur para o equilíbrio da deriva de mutação e para detectar a ocorrência de um evento de estrangulamento genético recente, se é que houve algum, nesta população. Cerca de 50 animais não relacionados, fiéis ao tipo, foram amostrados e genotipados em 25 microsatélites loci. A heterozigosidade média observada (0,808 ± 0,023) foi superior à heterozigosidade média esperada (0,762 ± 0,008) com 15 dos 25 micro loci de satélite a exibirem excesso de heterozigosidade quando assumidos sob o equilíbrio de Hardy-Weinberg. Para avaliar o gado de Bargur para equilíbrio de deriva de mutação, foram realizados três testes sob três modelos de mutação diferentes, a saber, modelo de alelo infinito (IAM), modelo de mutação escalonada (SMM) e modelo de mutação bifásica (TPM). A diversidade genética observada (H(e)) e a diversidade genética de equilíbrio esperado (H(eq)) foram estimadas sob diferentes modelos de evolução de microssatélites. Verificou-se que todos os 25 loci apresentavam excesso de diversidade genética sob IAM e TPM, enquanto 22 loci apresentavam excesso de diversidade genética sob SMM. Todos os três testes estatísticos, a saber, teste do sinal, teste das diferenças padronizadas, e teste do grau de Wilcoxon, revelaram desvio significativo (P < 0,01) da população bovina de Bargur do equilíbrio mutação-drift sob todos os três modelos de mutação. Além disso, o teste qualitativo da distribuição da frequência alélica na população bovina de Bargur revelou uma forte mudança de modo em relação à forma normal em forma de L, sugerindo que a população tinha sofrido um estrangulamento genético num passado recente. A ocorrência de estrangulamento genético pode ter levado à perda de vários alelos raros na população, o que aponta para a necessidade de esforços para a conservação deste importante germoplasma de gado. O presente estudo é o primeiro relatório a demonstrar a base genética do estrangulamento demográfico de uma população bovina indiana.